RepeatModeler
RepeatModeler 在运行过程中,会调用多个rmblastn同时运行,RepeatModeler的-pa 参数设置同时运行的rmblastn个数。每个rmblastn运行时会使用4个线程,因此RepeatModeler设置-pa 多线程参数时,程序实际使用的线程数为设置数的4倍,如 -pa 5,实际会使用20个线程,因此需要在作业脚本中申请20核,否则会出现节点负载过高,导致作业挂起。
本文阅读量 次本站总访问量 次
RepeatModeler 在运行过程中,会调用多个rmblastn同时运行,RepeatModeler的-pa 参数设置同时运行的rmblastn个数。每个rmblastn运行时会使用4个线程,因此RepeatModeler设置-pa 多线程参数时,程序实际使用的线程数为设置数的4倍,如 -pa 5,实际会使用20个线程,因此需要在作业脚本中申请20核,否则会出现节点负载过高,导致作业挂起。
本文阅读量 次