介绍

集群公共平台软件调用主要有2种方式

module¶

module使用之前需要配置，见 Module使用

目前module中包含几百个常用软件及常用库文件，另外也可以使用module调用常用生信数据库，见 NR等常用生信数据库使用。

module av 查看所有软件

module av a 查看软件名以a开头的软件

module av A 查看软件名以A开头的软件

modul load augustus/3.3.3 载入这个版本的augustus

因为有的软件名称首字母大小写不确定，搜的时候可以都大小写都可尝试。

singularity¶

singularity是专为HPC环境开发的一款容器，核心优点有3个：不需要常驻服务，使用时消耗的资源非常少；不需要特殊权限，普通用户就可以使用，多用户环境中安全性有保障；可直接使用docker镜像。

集群上下载了部分安装比较复杂的软件，放在/share/Singularity/下，可以直接调用，部分镜像列表见 集群singularity镜像列表。

具体的使用方式见 集群文档 Singularity使用。